Bilbao lennujaama teenindab üks terminal, mis on avar ja väga hästi korraldatud. Vahemaad on väikesed ja terminali sissepääsust kuni lennukini ei ole vaja kõndida rohkem kui 150 meetrit.
Esimene korrus on eraldatud saabuvate lendude jaoks, samal ajal kui 1. korrusel asuvad check-in'i letid ja ainus turvakontrollpunkt.
Transiidiala on ühine kõigi lendude jaoks. Passikontroll, mille taga asuvad mitte-Schengeni lendude väljumisväravad, asub pärast turvakontrolli värava B15 lähedal.
Interaktiivne kaart kõigi terminalide kohta on kättesaadav lennujaama ametlikul veebilehel: www.aena.es/en.
