Chania kasutab ühte väiksemat, kaasaegse välimusega terminali, kus on väga lihtne navigeerida. Kaugused lennukiteni on lühikesed, suvehooajal on oodata suuremat rahvamassi suhteliselt väikesel alal.
Schengeni alale sisenevate ja sealt väljuvate lendude registreerimine toimub ühises fuajees. Jaotus toimub pärast ühist turvakontrolli, mõned väravad on pärast passikontrolli, teised mitte.
Väljumis- ja saabumissaalid asuvad esimesel korrusel.
Lennujaam suletakse viimase ja esimese saabuva lennuki vahel, tavaliselt on lahtiolekuajad 4:00 kuni 0:00.
